Crear una única base de datos con los resultados de secuenciación genómica completa de las muestras de origen alimentario, ambiental y clínico en Andalucía.
Identificar la cepa del microrganismo de forma más precisa e inequívoca, gracias a la utilización del genoma completo, permitiendo incluso la atribución de la fuente y vías de transmisión.
Generar un espíritu de colaboración entre las distintas unidades de la Junta de Andalucía y otros ámbitos académicos y de investigación a nivel autonómico y nacional.
Dar un salto cualitativo en la investigación, no sólo estudios prospectivos sino también retrospectivos relacionados con la salud, incluso avanzar en la resistencia a antimicrobianos o presencia de genes de virulencia.
Adelantar el momento de intervención en el caso de brotes de enfermedad transmitidas por patógenos, disminuyendo la aparición de nuevos casos asociados.
El Sistema Integrado de Epidemiología Genómica de Andalucía (SIEGA) nace con el objetivo de identificar de una forma precoz mediante la secuenciación genómica, los patógenos implicados en Protección de la Salud y mejorar la toma de decisiones.
La coordinación y colaboración de una red de laboratorios de análisis (Clínicos, de Salud Animal y de Salud Pública), unidades de secuenciación y equipos de bioinformática, así como las unidades de Protección y Vigilancia de la Salud del SSPA, permiten la recopilación y análisis de datos genómicos y geográficos de patógenos de interés en Protección de la Salud.
Los profesionales implicados podrán acceder a una única base de datos públicos centralizada en el Área de Bioinformática Clínica del SSPA con el fin de comparar y analizar con un enfoque único, las investigaciones sobre brotes de enfermedades transmitidas por los alimentos, animales, medioambiental y cualquier otro tipo de afección, reduciendo así, las tasas de aparición de estos eventos.
La base de datos constituirá un sistema de información único cuyo potencial fomentará la investigación de estudios relacionados con el análisis de las rutas de infección, el origen de la fuente o con la aparición de otros eventos determinantes para la salud pública, como el estudio de la aparición de genes de resistencia antimicrobiana o genes de virulencia.
Mapa epidemiológico de los aislados de Salmonella enterica, Listeria monocytogenes, Campylobacter jejuni, Escherichia coli, Legionella pneumophila y Yersinia enterocolitica de la comunidad andaluza.
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